Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F1Q01094 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms