Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
FANCCQ00597 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms