Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM3AP98173 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM3AP98173 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms