Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VLDLRP98155 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms