Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPNP63162 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPNP63162 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms