Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERVK_113P63121 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms