Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVK-16P61578 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms