Protein–RNA interactions for Protein: P61353

RPL27, 60S ribosomal protein L27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27P61353 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL27P61353 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL27P61353 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL27P61353 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL27P61353 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL27P61353 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL27P61353 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL27P61353 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL27P61353 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL27P61353 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL27P61353 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL27P61353 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL27P61353 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL27P61353 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL27P61353 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL27P61353 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms