Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS3AP61247 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPS3AP61247 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms