Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2MP61081 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms