Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.7 ms