Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSWP56202 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSWP56202 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSWP56202 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSWP56202 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSWP56202 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSWP56202 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSWP56202 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSWP56202 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSWP56202 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSWP56202 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSWP56202 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSWP56202 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSWP56202 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSWP56202 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSWP56202 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSWP56202 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSWP56202 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSWP56202 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSWP56202 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSWP56202 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSWP56202 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSWP56202 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSWP56202 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTSWP56202 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSWP56202 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSWP56202 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSWP56202 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSWP56202 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSWP56202 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSWP56202 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSWP56202 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSWP56202 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSWP56202 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSWP56202 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSWP56202 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms