Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAG2P55895 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAG2P55895 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAG2P55895 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAG2P55895 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAG2P55895 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAG2P55895 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms