Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ELLP55199 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ELLP55199 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms