Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD23AP54725 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms