Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms