Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCLMP48507 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCLMP48507 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCLMP48507 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCLMP48507 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCLMP48507 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCLMP48507 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCLMP48507 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCLMP48507 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCLMP48507 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCLMP48507 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCLMP48507 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCLMP48507 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCLMP48507 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCLMP48507 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCLMP48507 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GCLMP48507 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GCLMP48507 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GCLMP48507 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GCLMP48507 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GCLMP48507 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCLMP48507 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCLMP48507 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCLMP48507 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCLMP48507 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCLMP48507 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCLMP48507 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCLMP48507 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCLMP48507 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCLMP48507 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCLMP48507 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCLMP48507 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCLMP48507 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GCLMP48507 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms