Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNT2P45379 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms