Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5CP41229 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms