Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms