Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEACAM6P40199 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms