Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms