Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA10P31260 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms