Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA5P30532 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNA5P30532 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNA5P30532 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNA5P30532 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA5P30532 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA5P30532 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA5P30532 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA5P30532 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA5P30532 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA5P30532 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms