Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD40LGP29965 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms