Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APCP25054 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCP25054 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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APCP25054 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCP25054 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APCP25054 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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