Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRDP23468 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRDP23468 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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