Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KB1P23443 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KB1P23443 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms