Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF1P21675 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF1P21675 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF1P21675 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF1P21675 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1P21675 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1P21675 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1P21675 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1P21675 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1P21675 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1P21675 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1P21675 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1P21675 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1P21675 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF1P21675 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TAF1P21675 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TAF1P21675 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TAF1P21675 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF1P21675 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms