Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PVALBP20472 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PVALBP20472 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PVALBP20472 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PVALBP20472 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PVALBP20472 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PVALBP20472 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PVALBP20472 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PVALBP20472 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PVALBP20472 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PVALBP20472 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PVALBP20472 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PVALBP20472 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PVALBP20472 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms