Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms