Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDSP20132 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDSP20132 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDSP20132 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDSP20132 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDSP20132 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDSP20132 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDSP20132 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDSP20132 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDSP20132 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SDSP20132 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDSP20132 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDSP20132 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDSP20132 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SDSP20132 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDSP20132 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDSP20132 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDSP20132 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDSP20132 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDSP20132 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDSP20132 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDSP20132 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDSP20132 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms