Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LIG1P18858 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LIG1P18858 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LIG1P18858 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LIG1P18858 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LIG1P18858 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LIG1P18858 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LIG1P18858 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms