Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NME1P15531 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NME1P15531 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NME1P15531 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NME1P15531 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NME1P15531 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms