Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRG2P13727 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PRG2P13727 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRG2P13727 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PRG2P13727 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRG2P13727 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRG2P13727 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRG2P13727 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRG2P13727 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRG2P13727 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRG2P13727 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRG2P13727 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRG2P13727 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRG2P13727 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG2P13727 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG2P13727 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG2P13727 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG2P13727 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG2P13727 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG2P13727 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG2P13727 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRG2P13727 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRG2P13727 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms