Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG2P13521 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG2P13521 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG2P13521 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG2P13521 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCG2P13521 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG2P13521 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG2P13521 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG2P13521 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG2P13521 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG2P13521 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG2P13521 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG2P13521 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG2P13521 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG2P13521 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG2P13521 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG2P13521 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG2P13521 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG2P13521 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCG2P13521 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCG2P13521 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCG2P13521 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCG2P13521 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCG2P13521 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms