Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYH1P12882 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYH1P12882 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH1P12882 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH1P12882 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH1P12882 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH1P12882 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH1P12882 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH1P12882 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH1P12882 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH1P12882 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH1P12882 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH1P12882 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH1P12882 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH1P12882 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH1P12882 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYH1P12882 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH1P12882 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH1P12882 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH1P12882 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH1P12882 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH1P12882 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH1P12882 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH1P12882 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH1P12882 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH1P12882 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYH1P12882 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH1P12882 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH1P12882 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH1P12882 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH1P12882 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH1P12882 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH1P12882 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYH1P12882 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH1P12882 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH1P12882 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH1P12882 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH1P12882 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH1P12882 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH1P12882 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH1P12882 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH1P12882 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH1P12882 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH1P12882 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH1P12882 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH1P12882 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH1P12882 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH1P12882 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH1P12882 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH1P12882 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH1P12882 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH1P12882 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH1P12882 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH1P12882 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH1P12882 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH1P12882 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms