Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms