Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTMAP06454 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTMAP06454 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTMAP06454 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTMAP06454 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTMAP06454 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms