Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD3O95983 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD3O95983 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD3O95983 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD3O95983 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD3O95983 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD3O95983 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD3O95983 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3O95983 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3O95983 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MBD3O95983 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MBD3O95983 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD3O95983 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD3O95983 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD3O95983 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD3O95983 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD3O95983 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD3O95983 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD3O95983 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD3O95983 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD3O95983 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD3O95983 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms