Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX4O95219 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX4O95219 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX4O95219 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX4O95219 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX4O95219 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX4O95219 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX4O95219 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX4O95219 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX4O95219 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX4O95219 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms