Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD6O60522 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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