Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
NDUFS5O43920 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
NDUFS5O43920 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms