Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms