Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SGSM2O43147 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms