Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A2O14975 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC27A2O14975 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms