Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRDCB7Z8K6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms