Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms