Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMIM1B2RUZ4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms