Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms